講述了在紐約市一條大街的地下管道里住著四只功夫高強(qiáng)的忍者神龜和他們的老師斯普林特——一只來(lái)自日本的超級(jí)大老鼠。神龜們各個(gè)驍勇善戰(zhàn)，身懷絕技，為了維護(hù)正義，保衛(wèi)城市家園，他們同狡猾的巴克斯特·斯多克曼博士、紫龍幫的壞蛋以及一伙神秘且訓(xùn)練有素的忍者(史萊德的部下)展開(kāi)殊死搏斗……　　這四只神勇無(wú)比、所向無(wú)敵、神氣十足的小烏龜，手執(zhí)武士刀、武士棒、雙節(jié)棍和鐵尺，披掛上陣英勇迎敵，團(tuán)結(jié)如兄弟，不畏邪惡與恐嚇，始終與妖魔鬼怪斗爭(zhēng)著……性格迥然的小烏龜還以知名藝術(shù)家、科學(xué)家命名(是當(dāng)時(shí)老鼠老師以文藝復(fù)興時(shí)期四位大師的名字命名的)，分別是他們的領(lǐng)導(dǎo)者達(dá)芬奇、個(gè)性沉穩(wěn)的多納泰羅、暴躁沖動(dòng)卻富有激情的拉斐爾和最愛(ài)搞笑的米開(kāi)朗基羅。這四只大名鼎鼎的小烏龜，是動(dòng)畫史上最強(qiáng)的忍者。