有一天，當(dāng)玩家醒來(lái)時(shí)，發(fā)現(xiàn)自己孤身一人處在一個(gè)沒(méi)有人類(lèi)，只有口袋妖怪的世界中，而自己也變成了口袋妖怪。為了尋找原因與恢復(fù)的辦法，玩家與同伴組成救援隊(duì)，接受來(lái)自其它口袋妖怪的委托，在不可思議的迷宮中展開(kāi)冒險(xiǎn)。登場(chǎng)精靈：到第三世代為止的所有精靈全部登場(chǎng)，加上第四世代的小卡比獸，共387只精靈。 第四世代的精靈魔尼尼、愛(ài)哭樹(shù)、瑪狃拉、路卡利歐作為雕像出現(xiàn)。